El emulador de navegador que utiliza Symfony para los tests funcionales no permite probar el comportamiento JavaScript de tus páginas. Así que si en tu aplicación es importante probar ese código, deberías utilizar la librería Mink junto con PHPUnit.
Obviamente si tu aplicación utiliza JavaScript en todas sus funcionalidades, sería mejor utilizar una herramienta de tests especialmente pensada para JavaScript.